بالرغم من التشابه بين أعراض مرض انفلونزا الخنازير الذي يجتاح العالم الآن، وأعراض الانفلونزا العادية أو الموسمية ، بيد أن هناك فروق جوهرية بين المرضين، ويمكن توضيح وتلخيص تلك الفروق في النقاط التالية:
1- الحرارة:
في الإنفلونزا العادية تكون نادرة،أما بإنفلونزا الخنازير تعتبر من اساسيات أعراض هذا المرض وقد تستمر في بعض الحالات الى 3 أو 4 أيام.
2- السعال:
في الانفلونزا العادية يكون مصحوب بالبلغم،أما في انفلونزا الخنازير يكون حاد وبدون بلغم (كحه جافه).
3- الآم الجسم و الصداع:
في الانفلونزا العادية تكون خفيفة ونادرة الحدوث، أما في أنفلونزا الخنازير تكون حادة جداَ وتعتبر من أساسيات الأعراض.
4- انسداد الأنف:
في الانفلونزا العادية تعتبر من الاساسيات ويتلاشى في أسبوع، اما في انفلونزا الخنازير لا توجد عوارض انسداد او رشح الأنف.
5- القشعريرة:
في الانفلونزا العادية نادرة الحدوث،اما في انفلونزا الخنازير تعتبر من اساسيات الاعراض لهذا المرض حيث ثبت ان 60 بالمئة من الحالات قد عانت منه.
6- التعب والارهاق:
في الانفلونزا العادية خفيفة الى حد ما، اما في انفلونزا الخنازير تكون حادة وقوية التأثير وتعتبير ايضاً من العوارض الاساسية للمرض.
7- العطاس:
في الانفلونزا العادية تكون من الاعراض الاساسية،اما في انفلونزا الخنازير تكون نادرة جداً.
8- مفاجأة المرض لجسم الانسان:
في الانفلونزا العادية تتطور الاعراض بشكل بطيء مع مرور الأيام،اما في انفلونزا الخنازير تتطور الاعراض بشكل مفاجئ وسريع في خلال 3 الى 6 ساعات فقط فهذه الانفلونزا تضرب الجسم بعنف.
9- الصداع:
في الانفلونزا العادية بسيط ونادر الحدوث،اما في انفلونزا الخنازير قوي ومتلازم مع اعراض هذا المرض.
10- إلتهاب الحلق:
في الانفلونزا العادية من اساسيات المرض،اما في انفلونزا الخنازيرغير موجود ونادر الحدوث.
11- الآم الصدر أو ثقل الصدر:
في الانفلونزا العادية خفيف وفي بعض الحالات متوسط، اما في انفلونزا الخنازير يكون حاد وشديد.